Reconocimientos
Nombramientos honorarios
- Director general vitalicio de la Fundación Dolores Olmedo.
- Miembro vitalicio del Consejo de la Crónica de la Ciudad de México.
- Vicepresidente y miembro fundador de la Sociedad de Amigos del Centro Histórico de la Ciudad de México
- Director general vitalicio del Museo José Luis Cuevas
- Miembro fundador de la Sociedad de Amigos del Museo Nacional del Virreinato
- Miembro fundador de la Sociedad de la Catedral Metropolitana.
- Director general de museos dependientes del Consejo Nacional para la Cultura y las Artes.
 
Condecoraciones
- Caballero de la Orden de las Palmas Académicas de Francia. 1947
- Caballero de la Orden de Polonia Restituta. 1948
- Oficial de la Legión de Honor, Francia. 1952
- Comandante de la Estrella Polar del Norte, Suecia. 1953
- Comendador de la Orden del Imperio Británico, Inglaterra. 1954
- Oficial de la Orden de Leopoldo, Bélgica. 1959
- Comandante de la Orden de Orange Nassau, Holanda. 1960
- Comandante de la Orden de Polonia Restituta. 1962
- Comandante de la Orden del Mérito Cívico de la República Italiana. 1963
- Comandante de la Orden del Mérito Cultural, Polonia. 1975
- Orden de la Bandera Yugoslava con Estrella de Oro en el Collar. 1975
- Gran Cruz Federal al Mérito, Alemania Federal. 1976
- Orden Nacional del Mérito en Grado Comendador, Francia. 1976
- Orden Francisco de Miranda, Primera Clase, Venezuela. 1976
- Oficial de la Orden Nacional de la Cruz del Sur, Brasil. 1979
- Premio Nacional de Arte Elías Sourasky, México. 1980
- Académico Emérito Honorario, (Arquitecto Honoris Causa), título otorgado por la Academia Nacional de Arquitectura del CAM SAM, México. 1984.
- Medalla otorgada por el INAH como investigador distinguido, México. 1985.
- Gran Cruz de la Orden de Alfonso X el Sabio, España. 1982
- Reconocimiento ICOM (Consejo Internacional de Museos) in memoriam, México. 2016
 
Homenajes póstumos
- 7 mayo de 1990. Su cuerpo es velado en el Palacio Nacional de Bellas Artes.
- 1990. El Banco Nacional de México organiza un homenaje, publica el libro Pensamientos; Fernando Gamboa y devela una placa en su memoria en el Palacio de Iturbide.
- 1990. En el Museo de Arte Moderno del INBA se nombra a su galería de exposiciones temporales Sala Fernando Gamboa.
- 1991. El Consejo Nacional para la Cultura y las Artes, Conaculta organiza un homenaje y publica el libro Fernando Gamboa, embajador del arte mexicano.
- 1992. Se inaugura el Museo José Luis Cuevas. Una de sus salas lleva el nombre de Fernando Gamboa.
- 1993. El Museo José Luis Cuevas, con la colaboración del Distrito Federal, el Consejo Nacional para la Cultura y las Artes, IBM de México y el Instituto Nacional de Bellas Artes, celebra la exposición “Homenaje a Fernando Gamboa. Pintura Mexicana, 1950-1980”, con la exposición que el mismo Gamboa había seleccionado cuidadosamente para la Galería de Ciencias y Arte de IBM de Nueva York, presentada en esa ciudad en el otoño de 1990.
- 1994. En el Museo Dolores Olmedo se crea la Sala de Artes Populares Fernando Gamboa.
- 1995. El Instituto Nacional de Bellas Artes, por conducto del Museo del Palacio de Bellas Artes y el Museo de la Estampa y en coordinación con el Museo Franz Mayer, organiza en homenaje tres exposiciones con obras de la colección del maestro Gamboa y publica un catálogo titulado Recordando a Fernando Gamboa. En esa ocasión se devela una placa con la que se da su nombre a la Sala Internacional del Palacio de Bellas Artes.
- 1996. El Departamento del Distrito Federal, a través de SOCICULTUR y la delegación Miguel Hidalgo, devela un busto de Fernando Gamboa, obra de la pintora y escultora Lorraine Pinto, en el Bosque de Chapultepec, entre el Museo Nacional de Antropología y el Museo Rufino Tamayo.
- 2000. Con motivo del décimo aniversario de su fallecimiento, sus excolaboradores del Fomento Cultural Banamex organizan un homenaje con la exposición colectiva “Diez años de ausencia “ y un ciclo de conferencias en el Fondo Cultural Carmen, A.C., en la Ciudad de México.
- 2004. La Filmoteca de la UNAM y la Promotora Cultural Fernando Gamboa A.C. presentan en las salas de cine del Centro Cultural Universitario el programa Historias recuperadas, con algunos de los films pertenecientes al Archivo Gamboa y depositados en la Filmoteca de la UNAM.
- 2004. Exposición documental “Gamboa-Rivera: crónicas de una magna exposición“, organizada por el Museo Casa Estudio Diego Rivera y Frida Kahlo junto con la Promotora Cultural Fernando Gamboa, A.C.
- 2009. Con motivo del 100.° aniversario del nacimiento de Fernando Gamboa, se organizan varias conmemoraciones:
- Reubicación del busto de Fernando Gamboa en el andador sobre el Paseo de la Reforma, entre el Museo Rufino Tamayo y el Museo de Arte Moderno, ambos museos promovidos para su creación y dirigidos por Gamboa. Dicho busto desapareció en el año 2013. Actualmente (2021) se encuentra en proceso la instalación del conjunto escultórico “Homenaje a Fernando Gamboa”, en el mismo sitio, con obras del maestro Vicente Rojo, la escultora Lorraine Pinto y el arquitecto Ronald Esquivel.
- La revista Proceso le dedica un amplio reportaje el 1 de marzo del 2009 compuesto por Gamboa: una, dos, tres veces heroico, por Rafael Vargas, El cuartelazo contra Allende, por Judith Amador Tello y Armando Ponce y Las Cartas del exilio Español, por Patricia Gamboa.
- Se presentó en el Museo Mural Diego Rivera la exposición “Fernando Gamboa: el arte del riesgo”, sobre su actuación en el Bogotazo en 1948.
- En el Museo de Arte Moderno se presentó la exposición “Fernando Gamboa: la utopía del arte”, sobre varias de sus museografías nacionales e internacionales.
- El Museo Universitario Tlatelolco participó con el montaje de la exposición “Fernando Gamboa y el pueblo español”, sobre su participación en el exilio español en 1937.
- 2010. En el Centro de la Imagen se presentó la exposición fotográfica, con varios materiales inéditos de David Seymour “Chim”, propiedad del archivo Gamboa, titulada “Chim/Gamboa: La conexión mexicana. Guerra, viaje, exilio 1938-1939”, sobre la campaña a favor de la República Española organizada por Gamboa.
- 2020. México en Japón; "Osaka '70, Exposición Universal, a 50 años de su Realización", con motivo del 111 aniversario del natalicio de Fernando Gamboa. Casa de la Cultura de la Asociación México Japonesa. 2020.